Οι εργαστηριακές υποδομές του ΤΕΤΔ περιλαμβάνουν δέκα εργαστηριακούς χώρους διδασκαλίας και έρευνας με πλούσιο εξοπλισμό, όπου διεξάγεται εκπαιδευτικό και ερευνητικό έργο υψηλού επιπέδου. Eιδικότερα το ΤΕΤΔ διαθέτει τα εξής εργαστήρια:

• Επεξεργασίας Τροφίμων
• Χημείας Τροφίμων
• Ανάλυσης Τροφίμων
• Μικροβιολογίας και Βιοτεχνολογίας Τροφίμων
• Μοριακής Βιοχημείας
• Τεχνολογίας και Ποιοτικού Ελέγχου Γάλακτος-Κρέατος-Αλιευμάτων
• Τεχνολογίας και Ποιοτικού Ελέγχου Σιτηρών-Αρτοσκευασμάτων
• Τεχνολογίας και Ποιοτικού Ελέγχου Φρούτων-Λαχανικών
• Οργανοληπτικού Ελέγχου
• Πληροφορικής

Επίσης, το Τμήμα διαθέτει εξοπλισμό μέτρησης βιομετρικών δεδομένων (σωματικού βάρους, δείκτη μάζας σώματος, κλπ) για εργαστηριακές εφαρμογές της διατροφής. Ειδικότερα, οι υποδομές που κατέχει το Τμήμα Επιστήμης Τροφίμων & Διατροφής είναι:

• 1 Εργαστηριακός Χώρος Χημείας Τροφίμων  μαζί με το παρασκευαστήριο του, συνολικής δυναμικότητας συνολικά ~25 θέσεων:

                       

• 1 Εργαστηριακός Χώρος Μοριακής Βιοχημείας  μαζί με το παρασκευαστήριο του, συνολικής δυναμικότητας συνολικά ~25 θέσεων:

                   

• 1 Εργαστηριακός χώρος Μικροβιολογίας – Βιοτεχνολογίας Τροφίμων με 1 παρασκευαστήριο,  δυναμικότητας ~35 θέσεων:

             

• 1 Εργαστηριακός χώρος Ενόργανης Ανάλυσης Τροφίμων, συνολικής δυναμικότητας ~10 θέσεων:

         

• 1 Εργαστηριακός χώρος Κυτταρικών Καλλιεργειών και Ανάλυσης Επιμολυντών Τροφίμων, συνολικής δυναμικότητας ~5 θέσεων:

              

• 1 Εργαστηριακός χώρος Η/Υ (Πληροφορικής), συνολικής δυναμικότητας ~20 θέσεων:

• 1 Εργαστηριακός χώρος Σιτηρών & Αρτοσκευασμάτων, συνολικής δυναμικότητας ~15 θέσεων:

                

• 1 Εργαστηριακός χώρος Τεχνολογίας Γάλακτος Κρέατος-Αλιευμάτων, συνολικής δυναμικότητας ~25 θέσεων:

               

• 1 Εργαστηριακός χώρος Οίνου & Ποτών, συνολικής δυναμικότητας ~10 θέσεων:

             

• 1 Εργαστηριακός χώρος Επεξεργασίας Τροφίμων, συνολικής δυναμικότητας ~45 θέσεων:

            

• 1 Εργαστηριακός χώρος Οργανοληπτικού Ελέγχου, συνολικής δυναμικότητας ~6 θέσεων: